Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX54Q8TDD1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX54Q8TDD1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms