Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l2Q6KAU8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms