Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt42Q6IFX2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt42Q6IFX2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms