Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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