Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CACNB2Q08289 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNB2Q08289 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms