Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msx2Q03358 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msx2Q03358 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms