Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms