Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ldb1P70662 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ldb1P70662 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ldb1P70662 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ldb1P70662 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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