Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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