Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms