Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tsc22d3Q9Z2S7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms