Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms