Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC8Q9Y2L5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms