Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNRF3Q9ULT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNRF3Q9ULT6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 789.8 ms