Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ASXL3Q9C0F0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ASXL3Q9C0F0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms