Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRIP1Q9BX63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms