Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC107Q8WV48 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms