Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rccd1Q8BTU7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rccd1Q8BTU7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms