Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kcnf1Q7TSH7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms