Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms