Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnga4Q3UW12 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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