Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NBPF1Q3BBV0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NBPF1Q3BBV0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms