Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTR4Q13639 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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