Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMAD4Q13485 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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