Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PSME1Q06323 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSME1Q06323 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms