Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB1P82279 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB1P82279 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB1P82279 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB1P82279 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms