Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RxrgP28705 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms