Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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HOXA3O43365 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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