Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Scarb2O35114 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scarb2O35114 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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