Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GNPATO15228 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GNPATO15228 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GNPATO15228 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GNPATO15228 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms