Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C1D1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C1D1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H7C1D1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C1D1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C1D1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1D1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1D1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1D1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1D1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H7C1D1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms