Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRAK1Q9UPV9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TRAK1Q9UPV9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms