Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms