Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chrnb2Q9ERK7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms