Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DenrQ9CQJ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DenrQ9CQJ6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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