Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms