Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDCA7Q9BWT1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA7Q9BWT1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms