Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms