Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM11

Tgm6, Transglutaminase 6, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm6Q8BM11 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tgm6Q8BM11 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Tgm6Q8BM11 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tgm6Q8BM11 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tgm6Q8BM11 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tgm6Q8BM11 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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