Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms