Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Zfp397Q7TNK4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms