Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBR3Q6ZT12 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms