Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hddc2Q3SXD3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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