Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDSNQ15517 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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