Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB1Q02818 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB1Q02818 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms