Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PKD1P98161 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PKD1P98161 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PKD1P98161 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PKD1P98161 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms