Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgcdP82347 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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