Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr1bP70700 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1bP70700 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms