Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GJA9P57773 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GJA9P57773 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GJA9P57773 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms