Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID4AP29374 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID4AP29374 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms